Meist asymptomatische Infektion mit Clostridioides difficile (grampositives Stäbchen). Durch die fäkal-orale Übertragung findet sich eine hohe Durchseuchungsrate bei Hospitalisierten und Kindern. Typischerweise kommt es durch Antibiotikagabe (z.B. bei Pneumonie oder HNO-Infektion) zu einer Schädigung der normalen Darmflora, sodass der relativ resistente C.-diff.-Keim den Dickdarm überwuchern kann. Folge ist dann die Antibiotika-assoziierte Kolitis, bei der hohes Fieber, Bauchschmerzen und die charakteristisch übelriechende Diarrhö zu erwarten sind.